《机器人笔记》是一部机器人动画，虽然观众的观看重心在机器人、科技、未来等方面，但主要剧情由男主角串联起来。男主角偶然发现一个口袋电脑中的少女并开始寻找君岛报告，整个剧情像游戏般逐渐展开。虽然并没有明确提到男女主是否在一起，但从动画中的细节可以推测他们已经幸福地在一起。
1. 男主角的寻找君岛报告之路】
男主角偶然发现口袋电脑中的少女爱理，并以很闲的理由开始寻找岛君报告。整个剧情像游戏般逐步展开，男主以完成任务为目标逐渐发掘剧情重点。
2. 剧情的深入推进】
《机器人笔记》的剧情通过男主的经历逐渐发展，整个故事有着很深的游戏进展。男主为了寻找君岛报告前进，带动故事的发展。
3. 完结季的心情】
电视动画完结季带来了幸福和痛苦的感觉。观众能够看到许多好动画的完结，但同时也感到可惜。《机器人笔记》作为一部不错的动画，剧情完整，给观众带来了复杂的体验。
4. 结局描写】
虽然动画中没有明确表示男女主是否在一起，但观众可以从一些细节中推测出他们已经幸福地在一起。最后的画面中，两人在夕阳下接吻，给观众带来满足感。
5. 综合分析】
综合以上内容，可以认为男女主在动画中的结局是在一起的。虽然动画的重心主要在机器人和科技等方面，但男主角寻找君岛报告的剧情线索与两人的感情发展相联系，通过细节展示他们的幸福结局。
根据以上分析，可以得出结论：《机器人笔记》中的男女主最终在一起。虽然剧情没有明确表达，但通过剧情的发展、男主角的行动以及最后场景的描绘，观众可以推测他们已经幸福地走在一起。这样的结局也给观众带来满足感，增添了整部动画的魅力。无论是机器人、科技，还是男女主角的感情线，都构成了这部动画的重要元素，使观众对未来和科技的探索产生了浓厚的兴趣。同时，《机器人笔记》的剧情发展和游戏元素也为观众带来了复杂、丰富的观影体验。