基金会和基金公司是基金管理机构，但它们在组织形式、募捐方式、所有权关系、权利义务和管理方式等方面存在本质区别。
1. 组织形式不同
基金会是非营利组织，不以营利为目的。它是在民政部门注册的独立法人，以从事公益事业为目的，依法成立的非营利机构。而基金公司是以营利为目的的组织，负责管理投资人的资产。
2. 募捐方式不同
基金公司通过募集公众投资者的资金来设立基金，并根据投资者的需求和风险偏好，将资金进行投资运作，追求投资回报。而基金会是利用自然人、法人或其他组织捐赠的财产，以从事公益事业为目的，依法成立的非营利法人。
3. 所有权关系不同
在基金公司中，投资人购买基金份额，成为基金的所有者，享有基金的收益和承担相应的风险。而基金会的发起人并不以出资额大小享有基金会的权利，也不承担基金会的法律责任，基金会的财产所有权属于基金会本身。
4. 权利义务不同
基金公司的投资人作为基金的所有者，在基金运作过程中享有基金份额的增值收益，并承担相应的风险。而基金会的发起人并不以出资额大小对基金会享有权利，承担法律责任的主体是基金会本身。
5. 管理方式不同
基金公司将投资人的资金投资于证券市场，并根据投资者的需求和风险承受能力进行投资管理。基金公司的投资决策取决于投资经理的判断和决策。而基金会的管理方式主要分为专案管理和基金负责人制度。专案管理是指基金会根据自身的使命和目标，设立专项基金来管理、使用募捐资金。基金负责人制度是指基金会委托或聘请专人担任基金会的负责人，负责日常管理和决策。
基金会和基金公司在组织形式、募捐方式、所有权关系、权利义务和管理方式等方面存在明显区别。基金会是非营利组织，以从事公益事业为目的；基金公司是以营利为目的的组织，负责管理投资人的资产。了解这些区别有助于我们更好地理解和应用基金机构的概念。